Az endokrin állapotok általános besorolása, a specifikus diagnosztikai és terápiás megközelítések és a szükséges multidiszciplináris csoportok összetétele szerint nyolc kialakult fő tematikus csoportot (MTG) határoztak meg az Endo-ERN-en belül. Ezek az MTGs szerv- és/vagy élettani alapúak, a betegek teljes élettartama során biztosítják az ellátást, és lefedik a veleszületett és szerzett betegségek teljes spektrumát. Az MTGs a következők:

• MTG1 Mellékvese
• MTG2 Kalcium és Foszfát Homeosztázis Zavar
• MTG3 Glükóz és Inzulin Homeosztázis Genetikai Rendellenességei
• MTG4 Genetikai Endokrin Tumor Szindrómák
• MTG5 Növekedés és Genetikai Elhízás Szindrómák
• MTG6 Hipofízis
• MTG7 Nemi Fejlődés és Érés
• MTG8 Pajzsmirigy

Az MTGs-en belül számos tematikus alcsoportot határoztak meg hormonális túltermelés, elégtelenség, rezisztencia és/vagy tumor növekedés alapján.

Ezen tematikus alcsoportok révén az Endo-ERN arra törekszik, hogy képes legyen megoldani a betegségspecifikus állapotok ki nem elégített szükségleteit és lehetővé tegye a rendkívül speciális beavatkozásokat az adott betegségben szenvedő betegek számára.